新型lncRNA MANTIS通過表觀遺傳調控促進內皮細胞血管生成
欄目:最新研究動態 發布時間:2017-08-03
長鏈非編碼RNA(lncRNA)可在表觀遺傳水平、轉錄水平和轉錄后水平調控編碼基因的表達,從而控制不同的生物過程。目前對lncRNA在表觀遺傳水平上的調控機制了解甚少。

福利双色球基本走势图 www.gbqemm.com.cn 長鏈非編碼RNA(lncRNA)可在表觀遺傳水平、轉錄水平和轉錄后水平調控編碼基因的表達,從而控制不同的生物過程。目前對lncRNA在表觀遺傳水平上的調控機制了解甚少。近期,德國歌德大學醫學系的Ralf P. Brandes團隊發現了新型lncRNA MANTIS,并描述它在表觀遺傳學調控中的作用。相關研究結果以“Long Noncoding RNA MANTIS FacilitatesEndothelial Angiogenic Function”為題發表在Circulation雜志上,雜志影響因子19.3。

背景:內皮細胞的血管生成功能受到許多機制的調控,但長鏈非編碼RNA(lncRNA)對血管內皮細胞的影響幾乎沒有被研究。研究人員著手鑒定新型和功能重要的內皮細胞lncRNAs。

材料:人臍靜脈內皮細胞(HUVEC)和其他細胞,血管高壓病人和健康肺組織,膠質母細胞瘤和健康人腦周圍組織內皮細胞,獼猴血管,小鼠和大鼠動物模型。

方法:LNA-GapmeRs, siRNAs 或 CRISPR/Cas9敲除;Affymetrix Exon-Array;Illumina BeadChip Array;RNA原位雜交;RNA Pulldown;熒光素酶報告基因實驗;免疫沉淀;質譜;RNA-seq;轉座酶無障礙染色質測序(ATAC-Seq)和染色質免疫沉淀。

結果:發現新型lncRNAMANTIS在特發性肺動脈高壓(IPAH)患者中下調,它與SWG / SNF染色質重塑復合物的催化亞基BRG1相互作用,維持持BRG1活性的ATP酶功能,調控核小體重塑。因此,MANTIS通過確保有效的RNA聚合酶II機械結合,調控血管內皮關鍵基因的轉錄。

研究思路:

1.    篩選和鑒定內皮血管生成相關lncRNA 
H3K4組蛋白脫甲基酶(JARID1B)已被證明通過限制基因阻遏蛋白的表達來維持正常的內皮基因表達,作者在靜脈內皮細胞(HUVEC)中敲除JARID1B,利用外顯子芯片篩選血管內皮相關lncRNA。


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